艾克斯时空。
这个世界的故事要从15年前说起，
也就是夏树初次来访之前，红紫两道光团追击着进入太阳系，最后这场跨越星际的战斗以紫色光团格利扎被打入太阳，红色光团艾克斯失去身体而结束。
那一天，
因为红紫之战导致的太阳超级耀斑爆发，沉睡在世界各地的谜之欧帕兹——火花人偶纷纷被激活。
地球防卫组织在对付陆续出现的怪兽和宇宙人同时，也承担起了回收不稳定状态火花人偶的回收、保管以及研究任务。
东京，
距离夏树离开正好过去15年，
宇宙大怪兽贝蒙斯坦吞下艾克斯和大地后飞往月球休息，Xio队员们不得不合力对付操控贝蒙斯坦的扎拉布星人。
“梵顿电磁诱导炮，发射！”
“砰砰砰！”
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